Hola soy de Ecuador, a mi la primera opción me suena más formal, me suena a libro. Creo que se utiliza más en España (puede que me equivoque) . Yo utilizaría la primera opción si quiero sonar mejor, por ejemplo si estoy hablando en la prensa o escribiendo un artículo, etc. Pero en conversación diría se murió (sin importar la causa). También utilizamos morirse para expresar emociones muy fuertes por ejemplo "me muero de pena", " se muere por verte" etc.
Creo que la regla que mencionas sería útil si necesitas pasar un exámen de gramática, pero en la vida cotidiana no es muy importante la causa sino el contexto (formal o informal).