En" Did you afraid?" Falta el verbo, porque Did sólo es la partícula interrogativa podrías decir: Did you feel afraid? (¿Te sentiste asustado?) entonces ya hay un verbo: feel=sentir. En Were you afraid? Como el verbo "To be" nunca lleva partícula interrogativa se coloca en primer lugar y ya no falta nada; el verbo es el "To be"=estar (¿Estabas asustado?)