Una pregunta, o dos!

"Cuál es la diferencia entre ... y ...?" - singular

1. "Cuál es las diferencias entre ... y ...?"

2. "Cuál son las diferencias entre ... y ...?"

3. "Cuáles son las diferencias entre ... y ...?"

Cuál es corecto, y por qué?

La correcta es la número 3, porque es una pregunta en plural "cuales", mientras si usas cual es singular (uno solo) "cual".