回答する前に日本語を訂正<ていせい>します。 1.文書→文 　2.いらないだと→いらないと 　3.教われました→教わりました 4.前言った文章の場合→１の（文の）場合 5.「は」と「に」とどちらでも→「は」と「に」（の）どちらでも 回答 ２の文も本来「夏休みにはどこか行きましたか。」ですから、「に」が使われています。それは名詞としての用法（「夏休みは7月20日から8月31日までです。」など）が一般的（メイン）だからです。時を表す「に」が必要です。「六時半」も同じです（「今（は）六時半です。」など）。これに対し「昨日」は名詞としての用法（「昨日は木曜日です。」など）も副詞としての用法（「昨日勉強しました。」など）も一般的です。ですからそのままの形で副詞（連用修飾語<れんようしゅうしょくご>）の働きをします。英語の「Yesterday I studied./ I studied yesterday.」も同じです。本来名詞ですが、このままで副詞として働いています（「at/on」などはいりません）。

１．夏休みにどこへ行きたいですか。――沖縄へ行きたいです。 ２．夏休みはどこか行きましたか。――ええ、行きました。 perhaps the two sentences have different focus . "夏休みにどこへ行きたいですか"focuses on the "どこ　行く"just as"where did you go in you summer holiday?"and answered "i went to 沖縄" ”夏休みはどこか行きましたか”　focuses on the "夏休み"just as "how about your summer holiday ,did you go angwhere " and answed this question "yes somewhere"

口語で、「夏休みどこに行きたいですか？」といいます。 もちろん「夏休みにどこに行きたいですか？」「夏休みはどこに行きたいですか？」両方正しいです。