[시설,서비스]를 이용하다 = use abstract or big things like service, facility, place, human(swindling), etc. [물건]을 사용하다 = use concrete or small things like tools, weapons, goods, objects, concepts, etc.

같은 뜻이지만 목적어에 따라 구분해서 사용할 때가 종종 있어요. 예를 들어 교통수단이나 장소에는 이용하다를 써요. 지하철/버스를 이용하다. 나는 머리를 자를 때 집 앞 미용실을 이용한다.