you can say "日本国".In generally,if the name of a country includes one Chinese character,then we'll call it "~+国"，otherwise, the "国" can be omitted.

The name 日本 comes from Japanese itself. It is not a "Chinese" name. No other country is called 本。 日本 = where the Sun begins i.e The Land of the Rising Sun

در واقع برای ناميدن کشورهای خارجی و يا اسامی که از زبانهای ديگر ترجمه شده، شايد به زبان چينی سختتر باشد چون الفبای ثابتی نداريم برای نوشتن فلان اسم خارجی بايد براساس تلفظ آن کلمات را انتخاب کنيم و اين روش نوشتن هم براساس عادت بود و کم کم رسم شد و چينيان دوست داشتند آن اسامی را کوتاه بخوانند و بنويسند مردم کم کم عادت کردند به آن اسامی که از واژگان طولانی تر کوتاه شده بودند مثلاً در اصل فرانسه را به 法兰西（fa3lan2xi1） ترجمه شده و بعداً فقط تلفظ اولين حرف که فا بود باقی ماند، به اضافۀ 国 يعنی کشور اسم فرانسه را 法国 می ناميدند

In Chinses (colloquialism),a noun of the country can be divided into several categories: 1、一个简称+ 国：比如：法+国=法国 英+国=英国； 德国、美国、泰国、还有中国； 2、除去上面说这几个国家，其他国家后面可以不用+国。比如日本、朝鲜、伊朗、伊拉克、意大利、波兰、阿根廷。 这是一个简单的记忆方法。在口语中就记住，除了中国、法国、英国、德国、美国、泰国这几个国家以外，基本上就不用在国家的名字后面再加“国”。比如西班牙、葡萄牙、尼日利亚等等。

these two responses above me are incorrect. the reason why we call japan 日本 is: in japanese, the japanese call their country as "yi pong"(this is pin yin but the pronunciation is correct, you can use google to translate and pronunce it), we translate it according to the pronunciation. in fact, in chinese, to call a name of a country, we have twoways: 1) pronunce the first syllable as chinese + 国 for example, france 法国 england 英国 2) pronunce the whole name of a country as chinese for example, india 印度 italy 意大利 mexico 墨西哥 (normally, we pronunce a name of a country according to his english pronunciation, but japan is very close to china, before english spread, china and japan has a very long histroy of communication, so we call japan 日本 according to its pronunciation in japanese, there is another country like this: North Korea , in chinese, we call it 朝鲜 cause the pronunciation of 朝鲜 is similar with its pronunciation in korean)