Ce "ne" ne veut en effet rien dire. Il s'utilise après les verbes exprimant la crainte, avec une phrase affirmative. Grevisse cite la phrase : "je crains que l'ennemi ne vienne". Quand la phrase est négative, le "ne" disparaît... : "je ne crains pas qu'il fasse cette faute". Oui, c'est une bizarrerie du français, ce n'est pas la seule.