Oui, "que faire ?" est une expression tout-à-fait usuelle, peut-être un peu vieillotte et littéraire. "Le voleur a embarqué le PC de mon fils, que faire maintenant ?". "Et quoi faire" ce n'est pas franchement très correct, même si on l'entend parfois. "Qu'est-ce que je peux faire ?", c'est l'expression habituelle, qu'on entend le plus souvent, à l'oral, bien sûr.