漢字によって違う。つまり前後の文脈を説明しないと正しい答えは得られない。下記は全部、「もとに」を表す言葉。 基に　　ある資料を基に～を作る　　(based on) 下に　　法の下に平等 (under ) 素に　　～の原料を素にしてスープを作る(made of)

「～をもとにして」と「～をもとに」は同じ意味です。 短く簡潔に言いたいときは「～をもとに」、長く丁寧に言いたいときや、それが「基礎・素材」だということを強調したいときは「～をもとにして」を使うことが多いと思います。 基礎、基準などの意味のときは「基」の漢字を使います。 (例）今日の会議の結論を基に（して）計画をたててください。Please make a plan based on the conclusion of today's meeting. レポートを書くとき、wikipediaをそのまま写してはいけません。でもwikipediaの情報を基にして調べるのはokです。When you write a report, do not copy&paste from wikipedia. But it's ok to search BASED on the information there. 素材、材料などの意味のときは「素」の漢字を使います。 （例）カレーライスのカレーを素に（して）カレーうどんを作れば簡単ですよ。It'd be easy if you make curry-udon from the curry sauce of curry-rice. 「under」の意味のときは「～"の"もとに」です。 例えば、「法の下に平等」とは言いますが、「法を下に平等」や「法を下にして平等」は言いません。（aluckyさんの例文を勝手につかわせてもらいました。ごめんなさい！！）

その表現の意味は　　　　　を判断の基準・材料などにして そして　おもとに　と　おもとにして　は同じ意味だと思います。 多分　をもとにして　と言う表現のほうがていねいです。