Imagino que en este caso, la profesora, haciendo referencia a una foto, le pregunta a la alumna: " ¿Dónde es?", haciendo referencia al lugar donde esta ese árbol. Se supone que la alumna al ver el árbol debería reconocer el lugar donde éste está. En muchos casos se podrían usar indistintamente.

Donde es se usa para una dirección o un lugar por ejemplo donde es el parque o si ves una foto preguntas donde es y tu reconoces la foto es mi casa Donde esta se usa para objetos por ejemplo donde esta mi bolsa o si ves una película donde esta el árbol refiriéndote a un lugar que conoces

Hola Baha , en resumen, las reglas para diferenciar entre "ser" y "estar" son las siguientes: When a noun follows the verb, use ser When an adjective follows the verb, decide between "essence" and "condition" **To tell where something is from, use SER * To tell where something is located right now, use estar To tell where an event is taking place, use ser en este caso se utiliza la regla ** que indica que el verbo a usar es "ser" , del cual "es" es su forma conjugada por eso la maestra preguntó "¿donde es?" cuando preguntas ¿donde esta? es porque algo se mueve de lugar (una persona, un lapiz, etc) (regla *) para mayor información: ver http://www.studyspanish.com/lessons/serest4.htm espero sea de ayuda. Saludos